Арбитражный суд Москвы отказал НК "ЮКОС" в иске и подтвердил законность решения межрегиональной инспекции Федеральной налоговой службы РФ по крупнейшим налогоплательщикам от 6 декабря 2004г. о доначислении компании налогов, штрафов и пени за 2003г. в размере около 170 млрд руб. В то же время суд снизил сумму взыскиваемых налогов на 72 млн руб. Налоговое ведомство требовало с НК "ЮКОС" взыскания 86,2 млрд руб. налогов, около 15 млрд руб. пени и 68,9 млрд руб. штрафов за указанный период. Кроме того, суд удовлетворил встречный иск ФНС РФ о взыскании с ЮКОСа 68,9 млрд руб. штрафов. Задолженность нефтяной компании по налогам и пени за 2003г. списывается со счетов компании во внесудебном порядке.
По информации ФНС, нефтяная компания в 2003г. использовала ту же схему ухода от уплаты налогов, что и в 1999-2002гг. По мнению налоговиков, ЮКОС совершал умышленные действия по искусственному оформлению оборотов с нефтью и нефтепродуктами через специально созданные организации, зарегистрированные в регионах со льготным налогообложением. Эти зависимые от ЮКОСа организации, считают в налоговом ведомстве, не выполняли требования, необходимые для предоставления налоговых льгот. Аналогичные иски налоговиков о взыскании доначисленных налогов, штрафов и пени за 1999-2002гг. были удовлетворены судом.